本发明公开了一种新能源供电系统的控制器装置及其控制方法,所述控制器装置包括:升压模块(1),降压模块(2),二极管(3),自动开关(4),升压驱动模块(5),降压驱动模块(6),采样控制模块(7),其中:采样控制模块(7)分别从升压模块(1)的输入点(A)、输出点(B),降压模块的输出点(C)采集电压和电流信号,经过处理运算后送入升压驱动模块(5)、降压驱动模块(6)以及控制自动开关(4)的闭合或断开;升压模块(1)在输入点(A)的输入电压Va低于设定值Vr时,对输入电压进行升压;在输入电压Va高于设定值